@HD VN:1.4 SO:unsorted @SQ SN:chr1 LN:249250621 @SQ SN:chr10 LN:135534747 @SQ SN:chr11 LN:135006516 @SQ SN:chr12 LN:133851895 @SQ SN:chr13 LN:115169878 @SQ SN:chr14 LN:107349540 @SQ SN:chr15 LN:102531392 @SQ SN:chr16 LN:90354753 @SQ SN:chr17 LN:81195210 @SQ SN:chr18 LN:78077248 @SQ SN:chr19 LN:59128983 @SQ SN:chr2 LN:243199373 @SQ SN:chr20 LN:63025520 @SQ SN:chr21 LN:48129895 @SQ SN:chr22 LN:51304566 @SQ SN:chr3 LN:198022430 @SQ SN:chr4 LN:191154276 @SQ SN:chr5 LN:180915260 @SQ SN:chr6 LN:171115067 @SQ SN:chr7 LN:159138663 @SQ SN:chr8 LN:146364022 @SQ SN:chr9 LN:141213431 @SQ SN:chrM LN:16571 @SQ SN:chrX LN:155270560 @SQ SN:chrY LN:59373566 @PG ID:BBMap PN:BBMap VN:38.94 CL:java -ea -Xmx114332m -Xms114332m align2.BBMap build=1 overwrite=true fastareadlen=500 in=//bbmap_not_in_skimmer.fasta ref=//hg19_main_mask_ribo_animal_allplant_allfungus.fa.gz minid=0.96 ambig=all 1055085_1028 16 chr4 49116952 3 13=1X11= * 0 0 ATTCCATGCCATTGCACTCGGGTTG * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055085_1028 272 chr4 49117517 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055051_979 0 chrY 58989823 3 13=1X11= * 0 0 CAACTCTTGTCTATGATCTGCCTAC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055051_979 256 chrY 58997754 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055036_1671 0 chrY 13456517 33 11=1X13= * 0 0 CACTCGGGTTGCTTCCATTCCATTG * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 971428_1562 16 chrX 138506415 11 18=1X14= * 0 0 GTGGTGATGGTGGTGATGATGGTGGTGATGATG * NM:i:1 AM:i:11 NH:i:1 893368_942 16 chr16 77386524 3 11=1X13= * 0 0 GTGATGGTGATAGTGGTGGTGGTGG * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:1 1041151_1314 16 chr14 73127463 3 11=1X13= * 0 0 ATGATGGTGATCGTGATGGTGATGG * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1041151_1314 272 chr17 72072238 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055045_710 16 chrX 81420 3 13=1X11= * 0 0 CGCAAACTTTAGATTCTGCATTGGG * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_710 272 chrX 83188 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_710 272 chrX 83919 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_710 272 chrX 88004 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_710 272 chrX 89772 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055018_3330 0 chr16 1075522 3 11=1X13= * 0 0 CGGCTTGGAGGATGCTGAGGTCCCC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055018_3330 256 chr16 1075570 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 893346_3043 0 chr18 20398542 1 3=1X29= * 0 0 GCCCGGTCACACACACACACACACACACACACA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:1 NH:i:1 1055045_1032 16 chr10 135500461 3 13=1X11= * 0 0 CTAGGCAGAGTATCGAGAAGAGTCC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_1032 256 chr18 110280 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_1032 272 chrY 13473799 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_1032 272 chrY 13480161 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055045_1032 272 chrY 13482959 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 971428_479 16 chr16 1075522 3 11=1X13= * 0 0 CGGCTTGGAGGATGCTGAGGTCCCC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 971428_479 272 chr16 1075570 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:2 1055097_3278 0 chrY 13687641 1 5=1X21= * 0 0 GGTATGGAATAGAATGGAATGCAAAGA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:1 NH:i:1 971427_907 0 chr18 107892 3 11=1X13= * 0 0 GTAACTCTGGTTTAAGCTCTGCCTA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 971427_907 272 chrY 13460248 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 971427_907 272 chrY 13469134 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 971427_907 272 chrY 13475781 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 971427_907 256 chrY 58988872 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1055032_159 16 chrY 13454657 33 11=1X13= * 0 0 CATTCCATTCCGTTCCACTCTGGTT * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 1041120_1089 0 chr2 3184286 3 13=1X11= * 0 0 ACCGACATGGGGAGGCTCACTATTC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1041120_1089 256 chr2 3184615 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1041120_1089 256 chr2 3184728 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1041120_1089 256 chr2 3184770 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 016039_562 0 chr1 219614034 33 11=1X13= * 0 0 AGATTAAGCATATATTCTGACTTTT * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 893364_627 16 chrY 58997354 1 13=1X11= * 0 0 GTCTAGGCTTTGCGTACAGTGGGCT * XT:A:R NM:i:1 AM:i:1 NH:i:1 1055074_510 16 chrY 13839681 34 12=1X15= * 0 0 GAATGGAATGTAATGGAGTGGAAAGAAG * NM:i:1 AM:i:34 NH:i:1 893351_1087 0 chr3 52866659 3 11=1X13= * 0 0 GAGGGGTTTTGCGGTCCCTAGTGCA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:3 893351_1087 256 chr3 52866693 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:3 893351_1087 256 chr3 52866727 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:3 1054927_302 16 chrY 13713506 3 10=1X15= * 0 0 TTGGAATGGAGTGGAGTGGAATGGAA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:1 893334_743 0 chrY 13456924 1 7=1X18= * 0 0 TTCCATTTCATTCCATTTCACTCCAC * XT:A:R NM:i:1 AM:i:1 NH:i:1 1055066_708 16 chr18 109055 3 11=1X13= * 0 0 TTTTATAAGCATTGCCTACAGGGAA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1055066_708 256 chrY 13467906 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1055066_708 256 chrY 13467973 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 1055066_708 256 chrY 13482069 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:4 893296_1561 16 chr21 43566723 33 11=1X13= * 0 0 AGGTTGGAGTCCCCCCCTGCACCCT * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 893294_730 0 chrY 13486579 33 11=1X13= * 0 0 ATACACAGAGCGTAGACAAGTGTCC * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 104314_7754 0 chr16 60032752 33 11=1X13= * 0 0 ATATATAAGGCTCATTAGAAATAGA * NM:i:1 AM:i:33 NH:i:1 1041170_2701 0 chr10 135501009 3 13=1X11= * 0 0 TAGGCAGATCCAAAACAAGAGTCCA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1041170_2701 272 chr18 109937 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1041170_2701 256 chrY 13466269 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1041170_2701 256 chrY 13468251 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 1041170_2701 256 chrY 13474348 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 886694_46 16 chr10 99586537 3 13=1X12= * 0 0 TGGTGATGGTGATAGTGATGGTGATA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:1 893275_463 16 chr3 40644587 1 18=1X8= * 0 0 AGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGTGTGA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:1 NH:i:1 893362_1011 16 chr16 70050445 3 11=1X13= * 0 0 ATGGTGATGGTAATGGTGATGATGA * XT:A:R NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 893362_1011 256 chr16 79106568 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 893362_1011 256 chr5 151664591 3 13=1X11= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 893362_1011 272 chr8 13367516 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5 893362_1011 272 chr8 30899890 3 11=1X13= * 0 0 * * NM:i:1 AM:i:3 NH:i:5