CB1_S1 bowtie /filepath/CB1_S1_L001_R1_P.fa /filepath/CB1_S1_L001_R2_P.fa 129 0.4 FR CB2_S2 bowtie /filepath/CB2_S2_L001_R1_P.fa /filepath/CB2_S2_L001_R2_P.fa 229 0.3 FR CB7_S3 bowtie /filepath/CB7_S3_L001_R1_P.fa /filepath/CB7_S3_L001_R2_P.fa 112 0.2 FR CB8_S4 bowtie /filepath/CB8_S4_L001_R1_P.fa /filepath/CB8_S4_L001_R2_P.fa 136 0.4 FR